Arrajoen reitti koskee seuraavia vesialueita: Alasenjärvi, Kymijärvi, Kärkjärvi, Pitkäjärvi, Kalliojärvi, Alvojärvi, Villähteen- Kukkanen, Pikku-Kukkanen, Iso-Kukkanen, Salajärvi. Arkiomaanjärvi, Kivijärvi, Oksjärvi, Sylvöjärvi, Arrajärvi ja alueen lammet ja joet. .
